依據(jù)《建設項目竣工環(huán)境保護驗收暫行辦法》第六條及第十四條規(guī)定，需要對建設項目配套建設的環(huán)境保護設施進行調(diào)試的，建設單位應當確保調(diào)試期間污染物排放符合國家和地方有關污染物排放標準和排污許可等相關管理規(guī)定。環(huán)境保護設施未與主體工程同時建成的，或者應當取得排污許可證但未取得的，建設單位不得對該建設項目環(huán)境保護設施進行調(diào)試。

　　納入排污許可管理的建設項目，排污單位應當在項目產(chǎn)生實際污染物排放之前，按照國家排污許可有關管理規(guī)定要求，申請排污許可證，不得無證排污或不按證排污。建設項目驗收報告中與污染物排放相關的主要內(nèi)容應當納入該項目驗收完成當年排污許可證執(zhí)行年報。因此，必須申領排污許可證后方可進行調(diào)試、竣工環(huán)保驗收監(jiān)測及自主驗收程序。

　　關于環(huán)評、驗收、排污許可、應急預案有關規(guī)定根據(jù)《中華人民共和國環(huán)境影響評價法》有關規(guī)定，環(huán)評應在項目開工前完成。根據(jù)《關于做好環(huán)境影響評價制度與排污許可制銜接相關工作的通知》，環(huán)境影響評價制度是建設項目的環(huán)境準入門檻，是申請排污許可證的前提和依據(jù)。

　　根據(jù)《中華人民共和國環(huán)境保護法》第四十五條規(guī)定，實行排污許可管理的企業(yè)事業(yè)單位和其他生產(chǎn)經(jīng)營者應當按照排污許可證的要求排放污染物;未取得排污許可證的，不得排放污染物。

　　根據(jù)《控制污染物排放許可制實施方案》環(huán)境影響評價制度是建設項目的環(huán)境準入門檻，排污許可制是企事業(yè)單位生產(chǎn)運營期排污的法律依據(jù)。新建項目必須在發(fā)生實際排污行為之前申領排污許可證，環(huán)境影響評價文件及批復中與污染物排放相關的主要內(nèi)容應當納入排污許可證，其排污許可證執(zhí)行情況應作為環(huán)境影響后評價的重要依據(jù)。

　　根據(jù)《企業(yè)事業(yè)單位突發(fā)環(huán)境事件應急預案備案管理辦法(試行)》第十七條規(guī)定，建設單位制定的環(huán)境應急預案或者修訂的企業(yè)環(huán)境應急預案，應當在建設項目投入生產(chǎn)或者使用前，按照本辦法第十五條的要求，向建設項目所在地受理部門備案。

　　企業(yè)新建項目在試運行階段，可能會產(chǎn)生實際的排污行為。根據(jù)相關法律要求，企業(yè)必須持證排污，不得無證排污。因此，企業(yè)在投入運行并產(chǎn)生實際的排污行為之前，應當取得排污許可證。這跟企業(yè)是否通過環(huán)保驗收沒有必然的關系。

　　排污許可證是對企業(yè)實際排污行為的許可，根據(jù)《建設項目環(huán)境保護管理條例》，試生產(chǎn)行為在竣工驗收之前，需要試生產(chǎn)的企業(yè)，不能等到驗收之后才申請許可證。不僅如此，哪怕企業(yè)連“試生產(chǎn)”都還沒有正式開始，只是在調(diào)試階段，但只要有實際的與生產(chǎn)相關的污染物產(chǎn)生了——即便污染物的類型、排放量跟正常運行之后不一樣，企業(yè)都必須在此之前獲得排污許可證。

　　此外，企業(yè)在申請排污許可證的時候，竣工驗收報告并不是前置條件，但是需要提交環(huán)評報告的批復文件。

　　因此，環(huán)評是首位的，而申請排污許可證需要在發(fā)生實際排污行為之前;而一旦裝置運行(試生產(chǎn)、試運行)就會排污，所以排污許可申請需要在環(huán)保驗收之前完成，且必須已經(jīng)取得環(huán)評批復(或完成登記表備案)。應急預案是投入使用前完成，那么自然是在試運行之前。

　　綜上，可以總結出以下這個流程：環(huán)評編制——取得環(huán)評批復(或完成登記表備案)——申請排污許可證——編制環(huán)境風險應急預案——試運行——開展竣工環(huán)保驗收——完成自主驗收——正式投產(chǎn)。